1、

　　2024年7月31日，西湖大學(xué)醫(yī)學(xué)院、西湖實驗室解明岐團(tuán)隊在Cell雜志上發(fā)表了題為“Multi-layered computational gene networks by engineered tristate logics”的最新研究成果，首次提出利用“三態(tài)門”電路/邏輯來設(shè)計基因線路的策略(TriLoS)，為人體細(xì)胞編寫“代碼”，使其能夠開展智能生物計算和細(xì)胞療法。研究提出的TriLoS設(shè)計理念，以“三態(tài)門”為基本邏輯單元，成功升級了生物計算的“編輯語言”，使設(shè)計哺乳動物細(xì)胞計算的 “基因軟件”能夠真正意義上模塊化、邏輯最簡化和工程化，從而實現(xiàn)單細(xì)胞的復(fù)雜邏輯計算網(wǎng)絡(luò)和細(xì)胞邏輯電路，更將“生物計算機(jī)”的概念應(yīng)用于復(fù)雜代謝性疾病的治療，根據(jù)疾病的狀態(tài)使細(xì)胞可以及時啟動不同的定制化治療程序。這項工作對現(xiàn)代智能生物計算的發(fā)展及其在精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的應(yīng)用具有重要意義。

　　文章鏈接：https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(24)00716-5

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　　2024年7月31日，西湖大學(xué)醫(yī)學(xué)院、西湖實驗室郭天南團(tuán)隊，聯(lián)合浙江省腫瘤醫(yī)院鄭智國、朱筧青，浙江大學(xué)華躍進(jìn)團(tuán)隊，在Nature Communications上發(fā)表了卵巢癌蛋白組學(xué)新研究“Proteomic landscape of epithelial ovarian cancer”，建立了上皮性卵巢癌的多病理類型蛋白質(zhì)組學(xué)全景圖，為改進(jìn)診斷和治療策略提供了新的見解。

　　文章鏈接：https://www.nature.com/articles/s41467-024-50786-z

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　　2024年8月1日，西湖大學(xué)工學(xué)院向宇軒團(tuán)隊以“Stabilizing Interlayer Repulsion in Layered Sodium-Ion Oxide Cathodes via Hierarchical Layer Modification”為題在材料期刊Advanced Materials上發(fā)表研究成果，他們提出“多層級”材料修飾策略，旨在穩(wěn)定鈉離子層狀氧化物材料的層間靜電斥力，從而抑制電極在高電壓處不利相變的發(fā)生。通過巧妙地“植入”不同的微量元素到層狀金屬氧化物的鈉層、過渡金屬層和氧層中，有效地“鎖定”了材料結(jié)構(gòu)，使其在充放電過程中更加穩(wěn)定。

　　文章鏈接：https://doi.org/10.1002/adma.202407519

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　　2024年8月6日，西湖大學(xué)理學(xué)院石航團(tuán)隊回顧了親芳香環(huán)π酸催化SNAr反應(yīng)的發(fā)展歷程，在Accounts of Chemical Research上發(fā)表題為“Nucleophilic Aromatic Substitution of Halobenzenes and Phenols with Catalysis by Arenophilic π Acids”的綜述文章。石航課題組基于過渡金屬π配位活化策略，開發(fā)了一系列親芳香環(huán)π酸催化的烷基鹵代物和苯酚的SNAr反應(yīng)。文章總結(jié)部分指出了領(lǐng)域內(nèi)現(xiàn)存的挑戰(zhàn)，期望通過催化劑的開發(fā)和π配位活化機(jī)制的研究而推動親芳香環(huán)π酸應(yīng)用的發(fā)展。

　　文章鏈接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39042917/

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　　2024年8月7日，西湖大學(xué)理學(xué)院、人工光合作用與太陽能燃料中心孫立成團(tuán)隊在Journal of the American Chemical Society上發(fā)表了題為“Cluster-Level Heterostructure of PMo12/Cu for Efficient and Selective Electrocatalytic Hydrogenation of High-Concentration 5?Hydroxymethylfurfural”的研究論文。研究團(tuán)隊通過在Cu納米線表面負(fù)載Keggin型磷鉬酸(H3PMo12O40，PMo12)團(tuán)簇，制備了團(tuán)簇級異質(zhì)結(jié)構(gòu)的PMo12/Cu催化劑。該催化劑能夠?qū)?-羥甲基糠醛(HMF)電催化加氫至2,5-二羥甲基呋喃(BHMF)，并且在高底物濃度(1.0 M)下表現(xiàn)出前所未有的高選擇性，法拉第效率高達(dá)98%，BHMF的生成速率高達(dá)4.35 mmol cm–2 h–1。相關(guān)工作不僅為醛類化合物電催化選擇性加氫催化劑設(shè)計提供了新思路，還為電催化劑異質(zhì)界面工程調(diào)控催化活性與選擇性帶來了更深的認(rèn)識。

　　文章鏈接：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.4c08205

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　　2024年8月8日，西湖大學(xué)理學(xué)院石航團(tuán)隊在JACS發(fā)表了題為“Amination of Aminopyridines via η6?Coordination Catalysis”的研究論文。石航課題組在研究中發(fā)展了吡啶環(huán)的η6配位活化策略，建立了釕催化的氨基吡啶與烷基胺的SNAr反應(yīng)，為雜芳環(huán)的官能團(tuán)轉(zhuǎn)化提供了新策略。

　　文章鏈接：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.4c07306

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　　2024年8月8日，西湖大學(xué)工學(xué)院鞠峰團(tuán)隊在2024年8月于環(huán)境領(lǐng)域國際期刊Environmental Science & Technology上以副封面發(fā)表了題為“Discovery of Candidatus Nitrosomaritimum as a new genus of ammonia oxidizing archaea widespread in anoxic saltmarsh intertidal aquifers”的原創(chuàng)性論文。研究團(tuán)隊在中國江蘇鹽城濕地的潮間帶含水層發(fā)現(xiàn)并命名了一個新的AOA屬Candidatus Nitrosomaritimum，通過比較基因組學(xué)與宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法揭示了該新屬的系統(tǒng)發(fā)育多樣性、分布規(guī)律及其在生物氮轉(zhuǎn)化中的重要作用。

　　文章鏈接：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.est.4c02321

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　　2024年8月12日，西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院、西湖實驗室唐鴻云團(tuán)隊在EMBO Journal發(fā)表了題為“Identification of BiP as a temperature sensor mediating temperature-induced germline sex reversal in?C. elegans”的最新研究成果。利用模式生物秀麗隱桿線蟲(C. elegans)，研究人員首次發(fā)現(xiàn)溫度依賴型性別決定的關(guān)鍵溫度感知因子BiP介導(dǎo)線蟲生殖腺性別決定并解析不同性別決定模式轉(zhuǎn)換機(jī)制。這一原創(chuàng)性發(fā)現(xiàn)部分解答了溫度依賴型性別決定領(lǐng)域的關(guān)鍵問題，即溫度是如何被感知并轉(zhuǎn)化為性別調(diào)控信號的。同時也解析了不同性別決定模式之間的相互轉(zhuǎn)換的機(jī)制，為研究自然界中生物個體靈活采用不同性別決定模式的策略帶來了全新的理解。

　　文章鏈接：https://www.embopress.org/doi/full/10.1038/s44318-024-00197-z

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　　2024年8月12日，西湖大學(xué)醫(yī)學(xué)院、西湖實驗室施紅軍團(tuán)隊在?Genome Medicine?雜志上發(fā)表了題為“ENU-based dominant genetic screen identifies contractile and neuronal gene mutations in congenital heart disease”的最新研究成果。該研究進(jìn)行了迄今為止最大規(guī)模的小鼠先心病正向顯性遺傳篩查。通過篩選一萬多例小鼠心臟，發(fā)現(xiàn)了一千多例先心病，其疾病類型和分布與人群中的先心病發(fā)病情況極為相似，為鑒定新的先心病致病基因提供了基礎(chǔ)。該研究首先建立了小鼠全基因組預(yù)期隨機(jī)突變模型，并將實驗觀察到的突變頻率與預(yù)期隨機(jī)突變模型進(jìn)行比對，鑒定與疾病顯著相關(guān)的突變基因。同時，該研究首次對一千多例先心病人群攜帶的罕見顯性遺傳突變進(jìn)行基因?qū)用娴倪z傳負(fù)擔(dān)分析，并將人類基因分析結(jié)果與小鼠遺傳篩選的結(jié)果相互驗證。研究結(jié)果提示，基因突變導(dǎo)致的早期胎兒血流動力學(xué)改變可能是先天性心臟病的重要風(fēng)險因素，并進(jìn)一步提出了多基因致病模型，其中包括心臟收縮和神經(jīng)調(diào)控基因，為先心病的預(yù)防和診斷提供了一個全新的視角。

　　文章鏈接：

　　https://genomemedicine.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13073-024-01372-x??

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　　2024年8月14日，西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院、西湖實驗室裴端卿團(tuán)隊在Nucleic Acids Research發(fā)表題為“ALKBH5 Governs human Endoderm Fate by Regulating the DKK1/4-mediated Wnt/β-catenin Activation”的研究論文，該研究首次揭示了ALKBH5在人體外早期內(nèi)胚層發(fā)育過程中的調(diào)控作用及其分子機(jī)制，并系統(tǒng)地闡述了“ALKBH5-GATA6-DKK1/4-Wnt/β-catenin”這條對于早期內(nèi)胚層命運決定不可或缺的調(diào)控路線。此外，這項工作還報道了經(jīng)典Wnt通路負(fù)向調(diào)節(jié)因子DKK1/4在該體系中對Wnt/β-catenin信號通路的新型調(diào)控模式。

　　文章鏈接：https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkae707/7738000?login=true

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　　2024年8月19日，中山大學(xué)陳永明教授、劉利新教授聯(lián)合西湖大學(xué)工學(xué)院助理教授張越在Nature Nanotechnology上發(fā)表了題為“Synthetic polypeptides inhibit nucleic acid-induced inflammation in autoimmune diseases by disrupting multivalent TLR9 binding to LL37-DNA bundles”論文，報道了針對自身免疫病的一種潛在治療策略，即使用陽離子聚多肽清除患者體內(nèi)游離的自體核酸(cell free DNA, cfDNA)，從而阻斷自體核酸對Toll樣受體9(TLR9)的異常激活和炎癥反應(yīng)。

　　文章鏈接：https://www.nature.com/articles/s41565-024-01759-2

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　　2024年8月19日，西湖大學(xué)工學(xué)院仇旻教授團(tuán)隊以“Precise and omnidirectional opto-thermo-elastic actuation in van der Waals contacting systems”為題，在Advanced Science發(fā)表研究成果，他們提出了一種在平坦固體界面上實現(xiàn)高精度光學(xué)微操控的技術(shù)，該操控技術(shù)可以驅(qū)動原本粘附在襯底上的材料在平面內(nèi)實現(xiàn)任意方向、亞納米精度的移動。

　　文章鏈接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/advs.202401418

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　　2024年8月20日，西湖大學(xué)工學(xué)院陸啟陽團(tuán)隊在JACS上以“Deconvoluting Surface and Bulk Charge Storage Processes in Redox-Active Oxides by Integrating Electrochemical and Optical Insights”為題發(fā)表研究成果，他們基于耦合電化學(xué)與光學(xué)原位表征的方法，提出了一種新的模型，能夠精確區(qū)分并量化表面與體相的電荷儲存行為。

　　文章鏈接：https://doi.org/10.1021/jacs.4c09261

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　　2024年8月20日，西湖大學(xué)醫(yī)學(xué)院郭天南團(tuán)隊聯(lián)合中國人民解放軍第二軍醫(yī)大學(xué)長海醫(yī)院楊成華、高旭團(tuán)隊，共同在Cell Reports Medicine發(fā)表了題目為“Proteomic landscape profiling of primary prostate cancer reveals a 16-protein panel for prognosis prediction” 的前列腺癌蛋白組學(xué)新研究。文章鑒定了三種具有顯著臨床和蛋白質(zhì)譜特征的前列腺癌分子亞型;提出并驗證了一個由16種蛋白質(zhì)組成的前列腺癌預(yù)后預(yù)測模型，該模型能夠有效預(yù)測前列腺癌(PCa)患者的生化復(fù)發(fā)，其預(yù)測效能優(yōu)于現(xiàn)有的基于臨床參數(shù)的預(yù)測方法，可為高風(fēng)險前列腺癌盡早提供有效的治療干預(yù)措施提供指導(dǎo);發(fā)現(xiàn)NUDT5和SEPTIN8可作為潛在的前列腺癌聯(lián)合治療靶點。

　　文章鏈接：https://www.cell.com/cell-reports-medicine/fulltext/S2666-3791(24)00400-2

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　　2024年8月24日，西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院、西湖實驗室裴端卿團(tuán)隊在Nature?Communications雜志發(fā)表研究論文，發(fā)現(xiàn)在體外細(xì)胞光-電實驗中，額外添加ATR會增強(qiáng)ChR2產(chǎn)生的電信號，但減弱了KCR1產(chǎn)生的電信號。這一現(xiàn)象揭示了內(nèi)源的ChR2/KCR1(endoChR2/KCR1)和添加外源ATR的ChR2/KCR1(exoChR2/KCR1)必然存在分子機(jī)制上的差異。并且，加入外源ATR后表達(dá)ChR2/KCR1細(xì)胞出現(xiàn)肉眼可見的顏色變化，且純化后的endoChR2/KCR1和exoChR2/KCR1蛋白同樣呈現(xiàn)不同的顏色，說明哺乳動物內(nèi)源發(fā)色團(tuán)不是簡單的ATR。

　　文章鏈接：https://www.nature.com/articles/s41467-024-51811-x

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　　2024年8月26日，西湖大學(xué)工學(xué)院姜漢卿團(tuán)隊以“Energy-efficient dynamic 3D metasurfaces via spatiotemporal jamming interleaved assemblies for tactile interfaces”為題在Nature Communications發(fā)表研究成果。他們提出了一種三維超表面設(shè)計的新策略，其可實現(xiàn)動態(tài)刷新且不依賴持續(xù)的能量輸入，可用于觸覺界面的設(shè)計。

　　文章鏈接：https://www.nature.com/articles/s41467-024-51865-x

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　　2024年8月29日，西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院、西湖實驗室裴端卿團(tuán)隊在 Nature?Communications?發(fā)表題為“Activation mechanisms of dimeric mechanosensitive OSCA/TMEM63 channels”的研究論文，揭示了OSCA/TMEM63的全激活機(jī)理。

　　文章鏈接：https://www.nature.com/articles/s41467-024-51800-0

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　　2024年8月29日，西湖大學(xué)理學(xué)院吳頡團(tuán)隊與王鴻飛團(tuán)隊和工學(xué)院陸啟陽團(tuán)隊合作在Advanced Science上發(fā)表了題為“Polar Metallicity Controlled by Epitaxial Strain Engineering”的研究論文。吳頡團(tuán)隊在研究中證明，極化金屬性可以通過控制施加于NdNiO3薄膜的外延應(yīng)力和控制薄膜的厚度來進(jìn)一步設(shè)計和優(yōu)化。認(rèn)為通過外延應(yīng)力誘導(dǎo)電極化性質(zhì)的思路應(yīng)該是普適的，適用于多種鈣鈦礦過渡金屬氧化物。這使得通過外延應(yīng)力將電極化性質(zhì)鐵磁以及超導(dǎo)性等融合于同一鈣鈦礦過渡金屬氧化物材料體系成為了可能，為設(shè)計和合成多功能過渡金屬氧化物材料開辟了一個新的途徑。

　　文章鏈接：https://doi.org/10.1002/advs.202408329

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　　近日，西湖大學(xué)工學(xué)院齊國君團(tuán)隊提出了一種名為均衡擴(kuò)散(Equilibrated Diffusion)的圖像定制方法，該方法利用頻率感知的文本嵌入和掩碼引導(dǎo)的擴(kuò)散過程，通過殘差參考注意力機(jī)制增強(qiáng)圖像與文本的一致性。該論文被A類國際學(xué)術(shù)會議ACM Multimedia 2024錄用，并入選口頭報告(Oral，比例3.97%)。論文地址：http://openreview.net/pdf?id=ERuypCHYvX代碼地址：https://github.com/maple-research-lab/EqDiff

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　　2024年9月2日，西湖大學(xué)理學(xué)院王兆彬團(tuán)隊在Angew. Chem. Int. Ed.上發(fā)表了題為“Radical-Based Enantioconvergent Reductive Couplings of Racemic Allenes and Aldehydes”的研究論文。研究團(tuán)隊基于光氧化還原、鉻和鈷的三催化體系，成功實現(xiàn)了消旋聯(lián)烯與醛的對映匯聚式的還原偶聯(lián)反應(yīng)。

　　文章鏈接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202413198

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　　2024年9月3日，西湖大學(xué)工學(xué)院李文彬團(tuán)隊與李子青團(tuán)隊合作，在JACS Au上發(fā)表題為“Aggregation Rules of Short Peptides”的研究成果。他們聯(lián)合開發(fā)了一種基于Transformer架構(gòu)的人工智能(Artificial Intelligence, AI)模型，用于預(yù)測四肽及五肽的聚集傾向性(Aggregation Propensity, AP)。該研究量化了每個氨基酸對肽聚集傾向性的貢獻(xiàn)度，為理解特定氨基酸如何影響聚集過程提供了深入見解。

　　文章鏈接：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacsau.4c00501

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　　2024年9月12日，西湖大學(xué)理學(xué)院鄧力團(tuán)隊在JACS上發(fā)表了題為“Synthesis of?α-Aminonitriles via Ammonium-catalyzed Reactions of Aminoacetonitrile”的研究論文。鄧力教授團(tuán)隊開發(fā)了一種α-氨腈的綠色合成策略。該策略選用廉價易得且無毒的氨基乙腈鹽酸鹽為起始原料，操作簡單，廣泛適用于結(jié)構(gòu)多樣的α-氨腈合成，可放大生產(chǎn)，可衍生合成，因此具有發(fā)展成為通用性α-氨腈綠色合成的前景。

　　文章鏈接：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.4c09789

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　　2024年9月18日，西湖大學(xué)理學(xué)院、人工光合作用與太陽能燃料中心段樂樂團(tuán)隊在Angew. Chem. Int. Ed.上發(fā)表了題為“Metal-Free Wet Chemistry for the Fast Gram-Scale Synthesis of γ-Graphyne and its Derivatives”的研究文章。段樂樂課題組成功開發(fā)了無金屬參與的親核交聯(lián)濕化學(xué)法路徑，用于GY的克級快速合成。該合成策略具有良好的官能團(tuán)耐受性和底物普適性，并已擴(kuò)展到制備多種富氟和/或富氮的GY衍生物。特別是以六氟苯為反應(yīng)底物快速合成GY及其衍生物的實驗，降低了材料合成的時間和經(jīng)濟(jì)成本，顯示出極大的應(yīng)用潛力，這將有利于推動該類碳材料在催化以外領(lǐng)域的應(yīng)用研究，為創(chuàng)新碳材料的發(fā)展鋪平了道路。

　　文章鏈接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/anie.202411228

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　　近日，西湖大學(xué)工學(xué)院袁鑫團(tuán)隊提出隱式擴(kuò)散先驗增強(qiáng)的深度展開網(wǎng)絡(luò)，引入了一種生成式的隱式擴(kuò)散模型，通過在生成的無退化的知識先驗來增強(qiáng)基于回歸的深度展開網(wǎng)絡(luò)。該論文被計算機(jī)視覺頂級會議ECCV 2024錄用，并入選口頭報告(Oral，比例約為2.3%)。

　　代碼地址：https://github.com/Zongliang-Wu/LADE-DUN

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　　近日，西湖大學(xué)工學(xué)院楊林團(tuán)隊和林濤團(tuán)隊提出最大規(guī)模、專家驗證的高質(zhì)量病理大模型測試基準(zhǔn)數(shù)據(jù)集PathMMU。該論文被計算機(jī)視覺頂級會議ECCV 2024錄用，并入選口頭報告(Oral，接受率約為2.3%)。

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　　2024年9月28日，西湖大學(xué)工學(xué)院Thomas Wanger團(tuán)隊受邀在Nature Communications期刊上發(fā)表了一篇綜述論文，通過系統(tǒng)評價對已知和潛在的納米/微米塑料的暴露途徑進(jìn)行了量化，并研究了其對昆蟲傳粉者和生物防治媒介的直接和間接影響。該論文重點關(guān)注了納米/微米塑料污染對個體、農(nóng)場和景觀層面的直接和間接影響，并提出了未來研究的議程，以避免納米/微米塑料污染對全球糧食生產(chǎn)造成嚴(yán)重但尚未被認(rèn)識到的威脅。

　　論文鏈接：https://doi.org/10.1038/s41467-024-52734-3

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　　2024年9月30日，西湖大學(xué)工學(xué)院雷亮團(tuán)隊以“Frozen saline sand can be highly permeable”為題在Geophysical Research Letters發(fā)表文章。他們發(fā)現(xiàn)，工程上用人工凍結(jié)法阻擋尾礦庫或者核電站污染水滲流的措施可能是低效甚至無效的。此外，地下水中賦存的重金屬離子、微塑料顆粒等污染物、微生物，甚至溶解在地下水的溫室氣體等都可能沿相互連通的未凍水通道快速輸運。

　　文章鏈接：https://agupubs.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1029/2024GL111946

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　　2024年10月2日，西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院、未來產(chǎn)業(yè)研究中心，西湖實驗室盧培龍團(tuán)隊與西湖大學(xué)醫(yī)學(xué)院陶亮團(tuán)隊合作在Nature Communications?雜志發(fā)表了題為“De novo?design of mini-protein binders broadly neutralizing?Clostridioides difficile?toxin B variants”的研究論文。該研究“從頭設(shè)計”(de novo?design)了一種廣譜的迷你中和蛋白，能夠以高親和力結(jié)合多種艱難梭菌毒素B(TcdB)亞型，并在細(xì)胞及動物模型中表現(xiàn)出高效且廣譜的保護(hù)作用。

　　文章鏈接：https://www.nature.com/articles/s41467-024-52582-1

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　　2024年10月4日，西湖大學(xué)醫(yī)學(xué)院、西湖實驗室鄭鉅圣團(tuán)隊聯(lián)合中國疾病預(yù)防控制中心營養(yǎng)與健康所的合作者共同在國際雜志Cell Reports Medicine發(fā)表了題為 “The temporal dynamics of gut mycobiome and its association with cardiometabolic health in a nationwide cohort of 12,641 Chinese adults”的研究論文，并入選雜志當(dāng)月的封面文章(Cover)。該研究首次基于萬人級、全國性跨地域人群隊列，全面刻畫了人類腸道真菌的結(jié)構(gòu)圖譜及動態(tài)變化。研究揭示了腸道真菌在心血管代謝健康中的潛在作用，挖掘出若干心血管疾病相關(guān)的腸道真菌，為心血管疾病風(fēng)險評估和早期預(yù)警提供了潛在的新型生物標(biāo)志物。

　　文章鏈接：?https://www.cell.com/cell-reports-medicine/fulltext/S2666-3791(24)00518-4

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　　近日，國際學(xué)術(shù)會議EMNLP 2024論文接收結(jié)果公布。西湖大學(xué)工學(xué)院人工智能系張岳實驗室、藍(lán)振忠實驗室、王東林實驗室、鄭冶楓實驗室共有9篇論文入選。自然語言處理中的經(jīng)驗方法會議(Empirical Methods in Natural Language Processing，簡稱EMNLP)由國際計算語言學(xué)協(xié)會ACL舉辦，是自然語言處理和人工智能領(lǐng)域重要的學(xué)術(shù)會議之一，在清華計算機(jī)學(xué)術(shù)推薦列表中認(rèn)定為A類會議。EMNLP 2024將于11月12日至11月16日在美國邁阿密舉行。

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　　2024年10月17日，西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院、未來產(chǎn)業(yè)研究中心，西湖實驗室謝琦團(tuán)隊與曹龍興團(tuán)隊合作在Nature Biomedical Engineering雜志發(fā)表了題為“Targeting overexpressed antigens in glioblastoma via CAR T cells with computationally designed high-affinity protein binders”的研究論文。該研究基于計算蛋白質(zhì)設(shè)計的方法從頭設(shè)計并篩選得到了針對膠質(zhì)母細(xì)胞瘤表面的高表達(dá)的腫瘤抗原EGFR和CD276兩個靶點高親和力的迷你結(jié)合蛋白(Binder)CAR結(jié)構(gòu)，同現(xiàn)階段臨床實驗中的相同靶點的scFv CAR結(jié)構(gòu)相比較，在臨床前模型中Binder CAR顯著提高了CAR T療法對于膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的治療效果。

　　文章鏈接：https://www.nature.com/articles/s41551-024-01258-8

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　　近日，中國計算機(jī)學(xué)會(CCF)推薦的A類國際學(xué)術(shù)會議NeurIPS 2024論文接收結(jié)果公布。西湖大學(xué)人工智能系19篇論文被錄用。其中，李子青老師實驗室錄用8篇，鄭冶楓老師指導(dǎo)學(xué)生錄用3篇，MAPLE實驗室、楊林老師實驗室、李曉飛老師實驗室、劉沛東老師實驗室、林濤老師實驗室、吳泰霖老師實驗室、藍(lán)振忠老師實驗室各錄用1篇，于開丞老師指導(dǎo)學(xué)生錄用1篇。神經(jīng)信息處理系統(tǒng)大會(Neural Information Processing Systems，簡稱NeurIPS)與國際機(jī)器學(xué)習(xí)大會(ICML)、國際學(xué)習(xí)表征會議(ICLR)并稱“機(jī)器學(xué)習(xí)三大頂會”。據(jù)悉，第38屆NeurIPS會議，將于2024年12月9日-15日在加拿大溫哥華會議中心召開。

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　　近日，西湖大學(xué)工學(xué)院袁鑫團(tuán)隊提出首個低位量化的視頻單曝光壓縮成像重建框架Q-SCI。相關(guān)工作 “A Simple Low-bit Quantization Framework for Video Snapshot Compressive Imaging”以口頭報告(Oral，接收率約為2.3%)的形式發(fā)表于計算機(jī)視覺頂級會議European Conference on Computer Vision(ECCV)。ECCV會議是計算機(jī)視覺三大頂級會議之一，錄用論文代表了計算機(jī)視覺領(lǐng)域2024年最高的學(xué)術(shù)水平。

　　代碼鏈接：https://github.com/mcao92/QuantizedSCI

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　　2024年10月，西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院、西湖實驗室Kiryl Piatkevich團(tuán)隊與俄羅斯莫斯科國家研究中心"庫爾恰托夫研究所"的Fedor Subach和美國底特律韋恩州立大學(xué)的Alice Walker合作發(fā)表的兩篇最新論文中分別報道了名為NeIle和Thyone的新型實用生物傳感器，它們給細(xì)胞內(nèi)關(guān)鍵生化成分的研究帶來了新的突破。NeIle側(cè)重于對蛋白質(zhì)合成和代謝所必需的支鏈氨基酸的可視化研究，而Thyone首次實現(xiàn)了哺乳動物細(xì)胞中硫酸根離子動態(tài)的可視化，這對許多生理功能的研究至關(guān)重要。這些傳感器代表了生物學(xué)研究的重要突破，為科學(xué)探索和潛在的治療方法開辟了新的途徑。

　　(Thyone)文章鏈接：

　　https://www.nature.com/articles/s42003-024-07020-9

　　(Nelle)文章鏈接：

　　https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acssensors.4c01055

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　　2024年10月23日，西湖大學(xué)理學(xué)院、國際極化激元研究中心Pavlos Savvidis團(tuán)隊在Science Advances上發(fā)表了題為“Qubit Analog with Polariton Superfluid in an Annular Trap”的研究成果。研究人員開發(fā)了一個新型的模擬量子計算新平臺，在極化激元的量子技術(shù)發(fā)展上又邁進(jìn)了一步。

　　文章鏈接：https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.ado4042

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　　2024年10月29日，西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院、未來產(chǎn)業(yè)研究中心，西湖實驗室裴唯珂團(tuán)隊和張延曉團(tuán)隊在Nucleic Acids Research雜志發(fā)表了題為“scLTdb: a comprehensive single-cell lineage tracing database”的研究論文。該研究開發(fā)了scLTdb (single-cell lineage tracing database, https://scltdb.com)，全球首個單細(xì)胞譜系示蹤數(shù)據(jù)庫。該數(shù)據(jù)庫旨在為研究人員提供強(qiáng)大的在線工具，在單細(xì)胞水平分析細(xì)胞命運和譜系關(guān)系，并預(yù)測參與細(xì)胞命運調(diào)控的分子程序。

　　文章鏈接：

　　https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkae913/7848853

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　　2024年10月30日，西湖大學(xué)醫(yī)學(xué)院 / 生命科學(xué)學(xué)院/ 西湖實驗室 / 未來產(chǎn)業(yè)研究中心郭天南團(tuán)隊和西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院Kiryl D. Piatkevich團(tuán)隊合作在Nature Communications上發(fā)表了空間蛋白組學(xué)新研究“Spatial proteomics of single cells and organelles on tissue slides using filter-aided expansion proteomics”，介紹了濾膜輔助膨脹蛋白組學(xué)(FAXP)技術(shù)在空間蛋白組學(xué)中的應(yīng)用。

　　文章鏈接：https://www.nature.com/articles/s41467-024-53683-7